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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211009662.6 (22)申请日 2022.08.22 (71)申请人 西安交通大 学 地址 710049 陕西省西安市碑林区咸宁西 路28号 (72)发明人 张杰 司茹 卢闻 潘晓艳  单媛媛 王瑾  (74)专利代理 机构 西安通大专利代理有限责任 公司 6120 0 专利代理师 安彦彦 (51)Int.Cl. C07D 231/56(2006.01) C07D 401/14(2006.01) A61P 35/00(2006.01) A61K 31/416(2006.01)A61K 31/4545(2006.01) (54)发明名称 一种可细胞内自组装的蛋白降解剂及其制 备方法和应用 (57)摘要 本发明公开一种可细胞内自组装的蛋白降 解剂及其制备方法和应用, 使用链接体将靶蛋白 配体Linifanib与靶蛋白配体S5中的一种和生物 正交基团降冰片烯连接, 获得带有生物正交基团 降冰片烯的靶蛋白配体; 通过连接链将四嗪基团 修饰在E3泛素连接酶配体上, 得到带有生物正交 基团四嗪的E3泛素连接酶配体; 通过分步给药的 方法, 使得带有生物正交基团降冰片烯的靶蛋白 配体与带有生物正交基团四嗪的E3泛素连接酶 配体先后进入细胞, 在细胞内发生生物正交反 应, 自组装形成蛋白降解剂。 本发明构建的细胞 内自组装蛋白降解剂的制备方法简单, 易于实 现, 并且收率较高, 克服了传统的蛋白降解剂的 缺陷, 能够用于制备治 疗癌症的药物中。 权利要求书2页 说明书12页 附图2页 CN 115385859 A 2022.11.25 CN 115385859 A 1.一种可细胞内自组装的蛋白降解剂, 其特 征在于, 该降解剂的结构式如下: 其中X=1~6, R1=CH3或Cl, R2=F或H, R3为甲基或氢, R4为亚甲基或苯基, R6为亚甲基或 羰基, R5为亚甲基或 2.一种如权利要求1所述的可细胞内自组装的蛋白降解剂的制备方法, 其特征在于, 包 括以下步骤: 通过链接体将靶蛋白配体Linifanib与降冰片烯连接, 或通过链接体将靶蛋白配体S5 与降冰片烯连接, 得到带有降冰片烯的靶蛋白配 体; 其中, 靶蛋白配 体S5的结构式如下: 通过连接链将四嗪基团修饰在E3泛素连接酶配体上, 得到带有四嗪的E3泛素连接酶配 体; 将带有降冰片烯的靶蛋白配体与带有四嗪的E3泛素连接酶配体先后进入细胞, 在细胞 内发生生物正交反应, 自组装形成可细胞内自组装的蛋白降解剂。 3.根据权利要求2所述的可细胞内自组装的蛋白降解剂的制备方法, 其特征在于, 带有 降冰片烯的靶蛋白配体过程以下过程制得: 靶蛋白配体Linifanib与链接体经酰胺缩合反 应, 或靶蛋白配体与链接体经酰胺缩合反应, 得到带有Boc保护基化合物, 然后经氯化氢的 乙酸乙酯脱除Boc保护基, 再与5 ‑降冰片烯 ‑2‑羧酸进行酰胺缩合反应, 得到带有降冰片烯 的靶蛋白配 体。 4.根据权利要求2或3所述的可细胞内自组装的蛋白降解剂的制备方法, 其特征在于, 带有降冰片烯的靶蛋白配 体的结构式如下: 其中, X=1~6, R1=CH3或Cl, R2=F或H。 5.根据权利要求2所述的可细胞内自组装的蛋白降解剂的制备方法, 其特征在于, 带有 四嗪的E3泛素连接酶配 体通过以下 过程制得: 将乙腈、 氰基化合物以及水合肼在三氟甲磺酸锌或三氟甲磺酸镍的作用下, 或将醋酸 甲脒、 氰基化合物以及水合肼在催化剂三氟甲磺酸锌的作用下, 经环化反应, 氧化脱氢, 形权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115385859 A 2成带有不同取代基的1,2,4,5 ‑四嗪类化合物, 然后在三氟乙酸的作用下脱去Boc 保护基, 再 通过连接链与E3泛素连接酶配体沙利度胺类似物连接, 形成带有四嗪的E3泛素连接酶配 体。 6.根据权利要求2或5所述的可细胞内自组装的蛋白降解剂的制备方法, 其特征在于, 带有四嗪 的E3泛素连接酶配 体的结构式如下: 其中, R3为甲基或氢, R4为亚甲基或苯基, R6为亚甲基或羰基, R5为亚甲基或 7.根据权利要求2所述的可细胞内自组装的蛋白降解剂的制备方法, 其特征在于, 蛋白 降解剂通过以下 过程制得: 将带有降冰片烯的靶蛋白配体溶液加入到含细胞的培养皿中孵育后, 再加入带有四嗪 的E3泛素连接酶配 体溶液, 孵育, 在细胞内经自组装形成蛋白降解剂。 8.一种如权利要求1所述的可细胞内自组装的蛋白降解剂在制备抗肿瘤药物中的应 用。 9.根据权利要求8所述的应用, 其特征在于, 抗肿瘤药物为选择性诱导PDGFR ‑β 蛋白降 解的药物。 10.根据权利要求8所述的应用, 其特 征在于, 抗肿瘤药物为 抗神经胶质瘤药物。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115385859 A 3

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